简述海藻提取dna过程中应注意的问题。
DNA提取的完整步骤:
1.取新鲜或冷冻样品的肌肉组织100ul-200ul或0.05g经95%ALC保存的样品组织。2.尽可能多的切取组织,分别放入1.5ml离心管中。
3.加入450微升裂解缓冲液(10毫米Tris-HCl ph 8.0;100毫米EDTA,pH8.0)
4.每管加入10% SDS 50-100 ul(70-80不定)(1-2%),再加入2.5-5ul(3ul)蛋白酶K (20mg/ml)。
最终浓度为100ug/ml,混合物在55℃下搅拌均匀3小时至过夜(期间试管反转数次)。5.向样品中加入150ul NaCl(盐析),在8000rpm的室温下离心20min,除去沉淀,然后加入到上清液中。
加入同体积(500ul)预冷的异丙醇(沉淀的DNA),混匀,20℃处理30分钟,以65438±04000 rpm离心65438±00分钟,除去上清液。用70%ALC洗涤沉淀物,离心除去ALC。室温下挥发ALC5-10min,加入500 ul Te和10 ul RNase(终浓度4mg/ul),即2.5ul. 37℃ 30min或65℃ 15min。
6.加入等体积的酸溶液(从DNA中提取蛋白质)并缓慢来回转动离心管65438±00分钟,以13000-15000rpm离心。
10分钟.用移液管(大尖头)小心取出上相,放入另一个干净的离心管中,不要碰到两相之间的白色蛋白层(视情况重复操作几次)。7.加入等体积的苯酚:氯仿(提取苯酚)(1: 1),轻轻摇匀,慢慢倒置混匀,10min 13000-15000 rpm离心。
5-10分钟,取上清液于干净的离心管中。
8.加入等体积的氯仿(氯仿:异戊醇(防止氯仿挥发)= 24: 1),轻轻摇匀,慢慢倒置,混匀。
以13000-15000转/分的速度离心5-10分钟。向上清液中加入1/10体积的2M NaCl和等体积的储存在-20℃的无水乙醇(或等体积的异丙醇)(沉淀的DNA),沉淀DNA 10分钟,以13000 rpm离心5min,除去上清液,加入100-10。45℃烘干15-30分钟,沿管壁用双蒸水洗涤(TE含量视DNA沉淀量而定,在80-250ul之间),溶解12-24 h,储存于-20℃备用。
注意事项:
1.裂解液要预热,抑制脱氧核糖核酸酶,加速蛋白质变性,促进DNA溶解。
2、苯酚必须碱平衡。苯酚具有很强的腐蚀性,溅到皮肤、黏膜、眼睛上会造成伤害,要注意防护。氯仿易燃易爆易挥发,有神经毒性作用,操作时应注意防护。
3.每个操作步骤都要温和,尽量减少DNA的人为降解。
4、取上清液时,不宜贪多,以防非核酸成分干扰。
5、异丙醇、乙醇、NaAc、KAc等。应预冷以减少DNA的降解,促进DNA和蛋白质的相分离和DNA沉淀。
6.提取DNA过程中所用的试剂和设备,要经过高压干燥处理,不加核酸酶。
7.所有试剂都是用高压灭菌的双蒸水制备的。