重庆中医研究所的特色科研
经过近80年的积累、奋斗和近年来的体制改革，该院已成为国内同行业知名的科研机构。至今已取得冬虫夏草人工栽培研究、火华根片治疗肾炎研究、人参茎叶提取皂苷新工艺研究、复脉定颗粒治疗心律失常研究、阿拉伯糖苷生物合成研究、靛玉红半合成研究、四川中草药资源研究。开发了肝康灵、火火花根片、白雪宁、金泽冠心胶囊、复脉定胶囊等40多个新药，与企业联合开发了天府可乐、亚洲威士忌、黄连药皂等40多个产品。参与地奥心血康、洁尔阴、芎石丸、速效枣仁安神胶囊、参附冻干粉针剂等新药研发；主持并参与编写了《四川中药志》、《中国初级本草图说》、《中国本草目录》、《中国药用动物志》、《中药粉末显微鉴定》、《羌族药》、《中华本草》等专著30余部。
重庆直辖10年来，该院先后承担了科技部、国家自然科学基金、国家发改委、国家中医药管理局等科技项目近30项，重庆市科技项目80余项，企业委托项目100余项，国际合作项目10余项。
1，中药生药学研究所
设有中药资源调查与动态监测、中药资源保护与可持续利用、中药资源评价与开发利用、民族医药资源研究四个研究方向。是国家中医药管理局生药学重点学科，濒危药材育种国家重点工程实验室。
2.中药种植研究所
主要从事中药良种繁育和配套栽培标准化栽培技术、药材生产适宜区划、中药种子种苗鉴定、评价和繁育技术、中药种质资源鉴定、评价和利用、中药种植技术培训和推广。拥有中药栽培与生理研究、中药新品种选育、中药种子与种苗研究、药材生物技术研究等重点研究方向。
3.虫草研究所(康定中藏医药科技有限公司)
该所主要从事高原珍稀濒危中藏药材的研究、基地建设、产品开发、生产和经营。重点开展冬虫夏草人工栽培及产业化技术研究和相关产品研发，为高原珍稀濒危中藏药材育种提供关键技术研究、果实孵化、产品开发、生产模式建立和果实推广平台。
4.中药化学研究所
是国家中医药管理局三级重点实验室。主要从事中药化学、标准和质量标准、新药和健康相关产品的研发、天然活性产物的发现和结构修饰。主要研究方向:中药有效成分及其标准品研究；中药的物质基础研究；民间和民族药物及天然活性产物的筛选和结构修饰；新药开发与研究(主要包括血管药物、抗肿瘤药物、中药急救药物、抗肝炎药物、老年药物、抗过敏药物、免疫抑制剂、降血脂药物等。);中药质量标准的质量评价和标准化研究:中药和天然产物的应用研究；健康相关产品开发研究。
5.中药制剂研究所
主要开展中药炮制理论研究、中药新制剂、新剂型、新技术及关键技术研究、中药生物药剂学及药动学研究三个主要研究方向，重点开展中药新药(有效成分、有效部位、复方)研发和中成药二次开发、中药新剂型(缓释、靶向给药、透皮给药等。)和中药新技术(乳化技术、微囊化技术等)。
6.中药药理毒理研究所(重庆药物安全评价中心)
国家中医药管理局三级重点实验室，重庆市药物安全评价中心(GLP)。主要围绕心血管、内分泌、代谢疾病中的主要药效学研究和中药有效部位的筛选，重点开展中药新药的安全性评价和药物的基础毒理学研究，同时为医药保健品相关行业提供中药、天然药物和生物制剂开发中的药理学和毒理学技术咨询服务。目前，重庆市药物安全评价中心可提供啮齿类和非啮齿类动物的单次和多次毒性试验、生殖毒性试验、安全药理试验、局部毒性试验和免疫原性试验。
7.实验动物研究所
该所是中国西部成立的第一家省级实验动物质量检测机构——重庆实验动物质量检测中心。重庆市与药理毒理研究所共同成立了重庆市首家通过国家GLP认证的药物安全性评价机构——重庆市药物安全性评价研究中心(GLP中心)；是国家发改委批准的国家生物产业(重庆)基地实验动物中心建设单位。重庆实验动物(SPF)生产基地。
8、中药应用开发室
中药应用开发室成立于1980。主要从事中药及天然产物的应用研究、中药健康相关产品的开发研究以及中药在非医疗领域的其他应用和开发研究。
研究室现有专职科技人员10人，其中具有高中级技术职称的研究人员7人。现有专用办公室和研究室，建筑面积650平方米。
此外，在重庆市旅游局的大力支持下，成立了“重庆旅游保健食品技术中心”，搭建了重庆旅游食品研发和技术交流平台。
9.科技信息中心
科技信息中心(原图书情报研究室)成立于1953。65438-0989本中心经重庆市科技成果查新咨询管理中心批准，为生物、中医药查新站。1999经国家中医药管理局中国中医药文献检索中心鉴定，批准为中国中医药文献检索中心重庆分中心。
信息中心拥有丰富的中医药文献，中外文图书超过1.5万册。中文期刊1400多种，外文期刊1000多种。有全国报刊目录、中国科技信息目录、CA、BA等中外文大型检索出版物，有维普中外文期刊全文数据库、CNKI中国期刊全文数据库等大型文献数据库。