同一个房产证一楼的中医和二楼的西医可以办证吗？

你不能。根据《中医诊所备案管理暂行办法》的相关规定，在市场监管部门备案的中医诊所不得提供西药服务，也不得提供存在不可控医疗安全隐患和风险的服务。所以不可能在同一个物业同时办理西医和中医的营业执照，只能选择全部中医或者全部西医治疗。