李时珍用450字写出了《本草纲目》的故事。
为了知道陶弘景的说法是否正确，李时珍亲自上山观察。在樵夫和猎人的帮助下，他抓到了一只穿山甲。从它的胃里解剖出大约一升的蚂蚁，证明穿山甲动物是吃蚂蚁的。陶弘景是对的。
但他从观察中发现，穿山甲吃蚂蚁时，是挠窝舔窝，而不是把蚂蚁引诱到甲胄里，吞到水里。李时珍肯定了陶弘景的正确一面，纠正了他的错误。
就这样，李时珍经过长期的实地考察，找出了许多药物的疑难问题，并于万历五寅年(公元1578年)完成了《本草纲目》的编纂。全书约200万字，52卷，收录药物1892种，新药374种，载体10000多种，图片1000多幅，是我国前所未有的药理学巨著。
其中纠正了许多错误，在动植物分类学等许多方面取得了突出的成就，对其他相关学科(生物学、化学、矿物学、地质学、天文学等)也有贡献。).达尔文称赞它是“中国古代的百科全书”。
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李时珍重视临床，推崇张，重辨病证，严格立法，合理用药。在治疗上，对古方进行修改，或制定新方，或使用民间单方更有效。
李时珍的学术思想和研究方法很有特色。在新的历史条件下，他根据自己的实践经验，改进了古代的科学方法，积累了新的科学研究经验。李时珍成功地运用了观察与实验、比较与分类、分析与综合、批判继承与历史考证等方法。
①观察和实验是本草研究的基本方法。李时珍亲自收集并仔细观察药物以得出真相的方法非常成功。分类是科学研究的重要任务，药物研究系统化的关键是如何建立分类标准。
李时珍打破了本草学中长期存在的上中下分类，确立了三界十六部的分类，使分类体系更加科学。此外，他在陶弘景主药分类的基础上，建立了更加完善的百病主药分类，创立了入经药分类。
(2)李时珍提出了八项任务，即释名、集释、辨疑、纠错、修、嗅、主治、发明、附方，以求弄清每一种药物。这八项任务并不是都有的，有的是五到六项。实际上是对每一种药物的系统分析和全面综合，并在分析的基础上高度概括和全面。
③批判继承和调查研究是李时珍研究的重要方法。他在研究每一种药物时，总是先查阅各种草药，评价其异同，并自己观察试验结果，加以参考:《本草经》只载枸杞之名，而不指明药用部位；名医别录指出根寒，子微寒。
李时珍经过研究，在批判继承的基础上，推陈出新，“在前人没有去过的地方发展”。这种精神贯穿了他的全部研究活动。
(4)李时珍亲力亲为，广泛向劳动人民学习，注重调查研究，这是另一种重要的研究方法。关于一种药有很多种说法，有的像酸浆，有的是苍耳，有的叫地。李时珍经过广泛的咨询，采集了各种草药看真相，得出的结论是:肥肉是猪膏之母。他从京城回来，看到车夫用旋覆花治疗跌打损伤，就肯定了他补气强筋、补劳的贡献。
隔壁孩子吃的是粮食，偶尔吃羊身上的，但都吐出来了，所以李时珍最先把这个品种引入草药。他从狩猎的记述中知道虎骨有强身健体的作用；从菜农那里，很清楚油菜是油菜，从工人那里，他学会了如何防止采矿中毒。山民、渔民、农民、鞋匠、猎人都是他的老师，这让他在调查研究中受益匪浅。
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