饮片面临的问题
药材来源和采集不规范。
由于我国中药种类丰富，同一种中药在不同地方使用，或者同一品种在不同地区名称不同。即使是属于同一品种的药材，由于生长地区和气候的差异，也会导致品质的不同。此外，不同的采收时间或加工方法也影响原药材中有效成分的含量。
加工工艺和质量标准不统一。
虽然国家规定中药饮片必须按照国家药品标准炮制(国家药品标准没有规定的，按照省、自治区、直辖市药品监督部门制定的规范炮制)。但由于省、市、自治区界定的地方标准缺乏约束力和权威性，没有统一的质量标准，导致同一药材的炮制方法多种多样，往往出现差异甚至矛盾，难以实现统一的质量控制。就饮片内在质量而言，国内外尚缺乏先进的、可操作的质量检测方法和控制技术、量化指标和公认的质量评价标准。到目前为止，我国仍然没有完整的中药饮片标准化体系。在实际应用中，大部分中药饮片的质量仍受地方标准控制，甚至不按标准操作；另一方面，现有标准只是经验总结，主观性强，难以统一，让人理解。比如“苍术用麸皮炒至暗黄”，大家对暗黄的标准看法不一。按照这个标准炮制饮片，会产生一些理化性质的变化，导致饮片质量不一致。
加工机制不清楚
有些饮片虽然目前炮制机理比较明确，如附子、附子、马钱子等，但经过炮制后，其毒性成分发生变化而消失，或含量减少或异构化；黄芩经过蒸煮软化切片，可以避免有效成分的损失。但相当一部分饮片的炮制机理尚不清楚，极大地阻碍了炮制品种的临床应用。比如进补药黄精，研究表明黄精用酒蒸后能起到更好的进补作用，刺激性降低。据文献报道，黄精多糖是其滋补作用的主要有效成分。但有研究表明，酒蒸后黄精中粗多糖含量降低，很难解释为什么黄精中多糖含量降低而滋补作用增强。
信息标准不统一。
主要在数量上。比如有的中药饮片按照中药材目录编号，有的按照中药功效编号，有的由中药饮片加工企业自行编号，导致同一品种在不同地区编号不同，容易混淆和出错。此外，信息不完整。比如前面提到的中药材目录中虽然有编号、名称、规格、产地，但没有标注药材来源，部分地区将品种或其他同属植物作为正品，造成品种混淆。然后就是分类不清。无论是按药用部位分类，还是按功能主治分类，全国都没有统一的标准。
工业化发展滞后。
饮片行业是中药行业的薄弱环节。纵观全国，中药饮片生产企业水平参差不齐，只有少数企业通过了GMP认证。大多数企业规模小，效益低，技术开发和创新能力弱，生产技术和设备落后，管理不规范。这种情况恐怕短时间内很难改变。
有识之士提出了解决瓶颈问题的相应对策。强调一定要注意饮片的真实性，即用于生产饮片的药材要求含有稳定的一组物质。其次，强调中药炮制必须以中医理论为基础，以中西医结合理论为指导，对传统炮制方法进行改革和完善。同时，要加强中药炮制机理的研究，包括减毒增效、放宽药性、新功效等原理的研究。通过揭示加工机理，制定出统一规范的最佳加工工艺。