国家中医药管理局出版了几期古籍目录。

39期。根据国家中医药管理局官网查询，国家中医药管理局网站公布了《国家中医药管理局综合司国家医药品管理局综合司关于公布古代经典方剂(龚毅散等7个小儿方剂)关键信息表的通知》，截至2023年5月31日，已公布古代经典方剂39期。