我喝了中药后胃灼热。

这是清热活血的方子。活血药物其实是缓解疼痛的。中医说“痛不会过，通则不痛”。如果血流通畅，就不会痛。至于跑步时的胸痛，则是大口呼吸引起的肺膨胀所致。吃药的痛苦估计是胸口淤血，药在发挥作用。因为不知道你的病是什么，只能推测。