黑龙江中医药大学第二附属医院的历史沿革
1992年5月，为优化办学结构，提高办学效益，促进教学、医疗、科研有机结合，黑龙江中医学院决定组建黑龙江中医学院第二附属医院，并报省政府批准。8月3日1992省编委发文，正式批准成立黑龙江中医学院第二附属医院(针灸推拿专科医院)。同时，经省政府和省中医药管理局批准，二附院和针灸科实行“科室合一”的新管理体制，对教学、医疗、科研、学生教育管理、党建、行政等方面进行统筹，实现了党和政府的统一领导。这种“院系合一”的新模式，开创了全国中医院校的先河。8月8日，1992，黑龙江中医学院第二附属医院正式成立。医院建的时候有200张床位，7000多平米的房子。
二附院以1995年7月通过“三级甲等医院”评审和1996年4月“国家中风病中医医疗中心”成立为转折点，进入全面可持续发展阶段。
1995年初，医院被评为“全省百家信得过医院”，为争创“三甲”赢得了重要筹码，增加了医院职工的信心和决心。在全院齐欣的努力下，于7月1995顺利通过黑龙江省中医院综合评估，被省中医药管理局批准为“三级甲等中医院”。至此，黑龙江中医学院第二附属医院用近三年时间完成了最初的目标，完成了从“针灸推拿专科医院”到以针灸推拿为特色的“综合性大型中医医院”的重大转折。
1995 10 10月25日，国家中医药管理局批准黑龙江中医学院第二附属医院为“国家中医中风医学中心建设单位”。1996年4月，“全国中医中风医学中心”在医院成立，这标志着黑龙江中医学院第二附属医院进入全面可持续发展阶段。
1996，随着大学的更名，我院也更名为“黑龙江中医药大学针灸推拿学院暨第二附属医院”。
2004年2月，孙出任院长。孙上任之初，就提出要坚持建设新的医疗大楼，并想尽一切办法筹集资金，把在医院原址上建设新医疗大楼的想法付诸行动。2005年3月底，正式破土动工，2007年6月竣工。
2007年8月18日，医院举行了新医疗大楼竣工15周年庆典。
2008年9月，张晓风成为总统。新一届领导班子明确，医院始终坚持“以人为本，以病人为中心”的宗旨和“中医立院，科技为先，医学教育振兴，造福世界和人民”的战略理念，加快了建设现代化中医医院的步伐。
2009年底，医院收入首次突破1亿元。
2011在医院“十二五”规划之初，医院提出了建设优势突出、特色鲜明的高水平现代化中医医院的宏伟目标。也是这一年，医院收入首次突破2亿元，实现了跨越式发展。医院在创建平安医院、群众满意医院、“三好一满意”医院等一系列活动中也取得了令人满意的效果。
2011 3月15日，经黑龙江省中医药管理局批准，黑龙江省针灸推拿康复医学中心正式落户中医药大学第二医院。
2011年4月28日，我院防病体检中心、长泰药房正式对外开放。
201165438黑龙江中医药大学康复医学学院正式成立，划归第二中医医院管理。
2013医院投资购买了正义路567号房产，成立了跃进社区卫生服务中心。
2013，医院开工建设哈南分院。