巧克力囊肿需要手术治疗吗？ 什么必须手术，什么可以用药物治疗，都有一定的治疗标准。巧克力囊肿不是内分泌问题，但存在时间长了会影响内分泌异常。坚持手术，可以在非月经期做，术后好好对待子宫，否则复发的可能性很大，就是术后还是很难怀孕。